آزمایشگاه پردازش سیگنال‌ها و تصاویر پزشکی

 

این آزمایشگاه در سال ۱۳۹۶ به سرپرستی آقایان دکتر موسی شمسی، دکتر سینا شامخی و دکتر حامد داننده و نیز خانم دکتر پیوند قادریان افتتاح شد. هدف از این آزمایشگاه، فراهم آوردن زمینه مطالعه و بررسی روی داده‌های تصاویر پزشکی و همچنین سیگنال‌های پزشکی با انجام پروژه‌های تحقیقاتی در زمینه تصویرگری پزشکی، پردازش تصاویر و سیگنال‌های پزشکی (EEG, ECG, EMG, EOG, EGG) ، آنالیز مبتنی بر تصویر جراحی‌های چهره، مدل‌های احتمالاتی در تحلیل تصاویر، مدلسازی سیستم‌های بیولوژیکی (مدلسازی سیستم شنوایی و سیستم خونرسانی و تنفسی)، طراحی و ساخت سیستم جامع الکتروفیزیولوژی و نیز محاسبه علوم شناختی است.

 


زمینه‌های تحقیقاتی:

  • Biomedical Image and Signal Processing
  • Image Based Facial Surgery Analysis
  • Genomic Signal Processing
  • Deep Learning
  • Neuroscience
  • Cognitive Science

لیست پروژه‌های تحقیقاتی در حال اجرا:

  • Intelligent cognitive workload estimation based on the psychophysiological signal classification and personality traits
  • Time-Frequency gait analysis for the detection of neurodegenerative diseases
  • An investigation of electroencephalogram similarity feature during a flanker task for the diagnosis of obsessive compulsive disorder
  • Parkinson's disease detection using electroencephalogram analysis in a reinforcement-learning task
  • An ECG-based obstructive sleep apnea detection using the combination of time-frequency decomposition techniques

مقالات چاپ شده و پروژه‌ای تحقیقاتی انجام گرفته در آزمایشگاه:

  1. N. Mostaghim, "Identification of cervical cancer biomarkers by processing microarray data based on unsupervised learning methods," Supervisor: M. Shamsi, Faculty of Biomedical Eng., Sahand University of Technology, 2021-now.
  2. A. Fahmi, "Cephalometry analysis of soft tissue in facial plastic surgeries based on orthogonal facial color images," Supervisor: M. Shamsi, Faculty of Biomedical Eng., Sahand University of Technology, 2021-now.
  3. A. Eidi, "Design of a micro-biosensor based on mechanical resonance configuration for aqua-environment by lab-on-a-chip applications," Supervisor(s): M. Shamsi, H. Badri, Faculty of Biomedical Eng., Sahand University of Technology, 2020- January 2022.
  4. Z. Bounik, "Soft-tissue modelling for surgical simulators in the data-driven approaches," Supervisor(s): M. Shamsi, M. H. Sedaaghi, Faculty of Biomedical Eng.., Sahand University of Technology, 2016-2020.
  5. F. Golabi, “Prediction of gene regulatory regions using signal processing," Supervisor(s): M. Shamsi, M. H. Sedaaghi, Faculty of Biomedical Eng., Sahand University of Technology, 2012-2019.
  6. Ezazi Y, Ghaderyan P. Textural feature of EEG signals as a new biomarker of reward processing in Parkinson’s disease detection. Biocybernetics and Biomedical Engineering. 2022;42:950-62.
  7. Ghaderyan P, Moghaddam F, Khoshnoud S, Shamsi M. New interdependence feature of EEG signals as a biomarker of timing deficits evaluated in Attention-Deficit/Hyperactivity Disorder detection. Measurement. 2022;199:111468
  8. Manzari F, Ghaderyan P. Sparse Coding classification and Analytic EEG Signal Representation for Obsessive Compulsive Disorder Detection. Iranian Journal of Biomedical Engineering. 2022;15:341-50(In Persian).
  9. Ghaderyan P, Dehghanpur E. An efficient method for Parkinson’s disease detection using handwriting features. Iranian Journal of Biomedical Engineering. 2022;15:321-30 (In Persian).
  10. Dehghanpur Deharab, E. and P. Ghaderyan, Graphical representation and variability quantification of handwriting signals: New tools for Parkinson’s disease detection. Biocybernetics and Biomedical Engineering, (2022). 42(1): p. 158-172.
  11. M. Saljuqi, P. Ghaderyan, A novel method based on matching pursuit decomposition of gait signals for Parkinson’s disease, Amyotrophic lateral sclerosis and Huntington’s disease detection, Neuroscience letters, (2021) 136107.
  12. P. Ghaderyan, G. Fathi, Algebraic Analysis of Vertical Ground Reaction Force Signal for diagnosis and Differentiation of Parkinson's Disease Severity, Iranian Journal of Biomedical Engineering, (2021)( In Persian).
  13. M. Saljuqi, P. Ghaderyan, Detection of Neurodegenerative Diseases Using Time-frequency Symmetric Features of Gait Signal, Iranian Journal of Biomedical Engineering, 15 (2021) 41-50( In Persian).
  14. P. Ghaderyan, G. Fathi, Inter-limb time-varying singular value: a new gait feature for Parkinson’s disease detection and stage classification, Measurement, (2021) 109249.
  15. P. Ghaderyan, A. Abbasi, Sparse coding classification and cepstral singular value for cognitive workload estimation, Computers & Electrical Engineering, 91 (2021) 107031.

پروژه‌های کارشناسی ارشد و دکتری خاتمه یافته و در حال اجرا:

پیش بینی نواحی تنظیمی ژنی با استفاده از پردازش سیگنال (خاتمه یافته)

تحلیل عملکردی مغز کودکان با اختلال نارسایی توجه / بیش فعالی و طبقه بندی آن با استخراج ویژگی‌های سیگنال EEG (خاتمه یافته)

بخش بندی و استخراج ضایعات مغزی با ادغام مدالیته های مختلف تصاویر MRI و بر اساس الگوریتم‌های یادگیری ماشین (خاتمه یافته)

طبقه بندی داده‌های بیان ژن‌های مرتبط با سرطان با پردازش تصاویر ریزآرایه (خاتمه یافته)

بخش‌بندی تصاویر MRI مغز انسان توسط روش‌های مبتنی بر الگوریتم‌های بهینه‌سازی ازدحام ذرات بهبودیافته (خاتمه یافته)

مدل سازی مبتنی بر داده بافت نرم برای شبیه سازهای جراحی (خاتمه یافته)

طراحی و ارزیابی ریزسنسور بیولوژیکی مبتنی بر ساختار نوسانگر مکانیکی برای آنالیز قطره در کاربردهای آزمایشگاه روی یک تراشه (خاتمه یافته)

آنالیز سفالومتری بافت نرم در اعمال جراحی پلاستیک چهره با الگوریتم‌های هوشمند (خاتمه یافته)

شناسایی نشانگرهای زیستی سرطان دهانه رحم با پردازش داده‌های ریزآرایه مبتنی بر روش‌های یادگیری بدون نظارت (در حال اجرا)

بخش بندی تصاویر MRI مغز انسان توسط روش‌های مبتنی بر الگوریتم‌های بهینه سازی ازدحام ذرات بهبود یافته

تحلیل ریخت شناسی بطن‌های مغزی از روی تصاویر MRI مغز انسان

تشخیص آپنه انسدادی خواب بر پایه سیگنال الکتروکاردیوگرام و با استفاده از ترکیب روش‌های تجزیه زمانی - فرکانسی

ثبت و تحلیل داده‌های ذهنی، عملکردی و روانی - فیزیولوژیکی برای شناسایی بارکاری شناختی به کمک یادگیری ژرف

شخیص زبان اشاره فارسی بر پایه روش‌های زمان-فرکانس


دانشجویان فارغ التحصیل و فعال آزمایشگاه:

فائقه گلابی (فارغ التحصیل دکتری)

شیوا خشنود (فارغ التحصیل دکتری)

طناز اکبرپور (فارغ التحصیل دکتری)

حمیدرضا صابرکاری (فارغ التحصیل دکتری)

محمدجواد عموشاهی (فارغ التحصیل دکتری)

زهرا بونیک (فارغ التحصیل دکتری)

امین عیدی (فارغ التحصیل دکتری)

سید حامد اصفهانی (فارغ التحصیل کارشناسی ارشد)

معصومه پورعزت (فارغ التحصیل کارشناسی ارشد)

شیما محمدی (فارغ التحصیل کارشناسی ارشد)

مسعود مرادی (فارغ التحصیل کارشناسی ارشد)

نیر مستقیم بخشایش

علی فهمی

اکبر علیپور صیفار

نیلوفر باقری

مهدی بشیری باویل

سید هادی هاشمی

محمد جواد عمو شاهی

عباس درویش فشتمی

زهرا اصغرزاده بناب

فاطمه شالچی زاده

اصلان مدیر

آرمین قسیمی

المیرا بقای فر